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Identification de loci associés aux taux de globules rouges, globules blancs, et plaquettes chez des Caucasiens et des Afro-Américains : le projet CARe

Ken Sin Lo
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Ken Sin Lo

Résumé de la communication

Les taux de globule rouge (RBC), de globule blanc (WBC) et de plaquette (PLT) sont des caractères fortement héréditaires. Ces phénotypes quantitatifs sont de grande importance pour l'homéostasie, et sont souvent déréglés dans les maladies humaines et lors d’infections. L'identification des polymorphismes génétiques qui modulent les paramètres sanguins permettra de comprendre les facteurs qui expliquent ces variations phénotypiques naturelles et d’élucider les voies biologiques qui commandent la différentiation et la prolifération des cellules souches hématopoïétiques. Dans le projet CARe, des Caucasiens et des Afro-Américains ont été génotypés sur des micropuces ITMAT-BROAD-CARe iSELECT. Ces micropuces contiennent ~50 000 polymorphismes nucléotidiques qui capturent la variation génétique de ~2100 gènes. Pour cette étude, les phénotypes sanguins étaient disponibles pour les cohortes ARIC, CARDIA, CHS, FHS et JHS, comportant 23 439 Caucasiens et 7112 Afro-Américains. Nous avons effectué des analyses d'association basées sur une régression linéaire avec le logiciel PLINK. Les résultats ont été combinés en suivant une méthode de méta-analyse avec le logiciel METAL. Nos résultats ont reproduit l'association connue entre le taux de WBC et le locus Duffy chez les Afro-Américains (P-value=1x10[SUP -50]). Nous avons identifié des associations génétiques additionnelles pour les taux de RBC, de WBC et de PLT. Nous présenterons les résultats de réplication dans des cohortes indépendantes.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 12 mai 2010
host icon Hôte : Université de Montréal

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