Communication

Scripto – un système facilitant la gestion de données et les tâches d’analyses à haut débit

Frédéric Latour

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Frédéric Latour

Résumé de la communication

Les laboratoires de recherche utilisant des outils d'analyse à haut débit doivent faire face à un déluge de données, d'où la nécessité de systèmes informatiques spécialisés permettant d'assister les usagers dans les différentes tâches d'un projet de recherche, du schéma expérimental à l'analyse des résultats. L'étude de maladies à traits complexes sur des cohortes de milliers d'individus requiert l'organisation des informations récoltées sur les participants de même que des millions de différences interindividuelles mesurées à l'échelle du génome entier par les méthodes à haut débit. En assistant l'usager du début à la fin d'un projet, Scripto en facilite les différentes étapes et permet d'assurer un suivi des travaux et de l'ensemble des fichiers générés. Il permet aussi de rendre plus accessibles les logiciels d'analyse, souvent complexes par leurs nombreuses options. En adoptant une programmation orientée objet et en concevant un outil modulaire, nous facilitons l'ajout progressif de nouvelles fonctions, tel que la gestion de nouveaux types de matériel biologique ou d'analyses. L'architecture modèle-vue-contrôleur facilite la programmation de notre outil en permettant une division de la représentation des données, de la logique du système et de l'interface web avec laquelle interagit l'usager. Ce système facilite ainsi la gestion des données associées aux divers types de projets réalisés dans le laboratoire.

Contexte

Section :

L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois

Domaine de la communication :

L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois

Date : 12 mai 2010

Hôte : Université de Montréal

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