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Un criblage à haute densité de la région du CMH identifie deux signaux indépendants de susceptibilité à la colite ulcéreuse

Mariana Chagas
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Mariana Chagas

Résumé de la communication

Le complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) est une région associée à plusieurs maladies auto-immunes et inflammatoires. Le CMH, qui englobe 7.6Mb de la région 6p21.3, contient 421 gènes, dont 40% codent pour des protéines aux fonctions immunologiques. La colite ulcéreuse (CU), est une maladie inflammatoire chronique du colon et rectum impliquant des facteurs génétiques et environnementaux. Plusieurs études de liaison et d’association pangénomiques ont indiqué que le MHC joue un rôle important dans la susceptibilité à la CU, mais aucune d’entre elles n’a réussi à préciser l’origine du signal. Pour notre étude, nous avons sélectionné un groupe de SNPs capturant la variabilité du CMH, et avons effectué un criblage dans une cohorte de 980 cas de CU et 640 contrôles. De plus, avec des approches d’imputation, il nous est possible de capturer les allèles communs des gènes HLA. Nos résultats préliminaires indique que 11 SNPs distribués a travers le CMH sont associé de façon significative à la CU (P<1E-5), et que le signal principal est localisé près du gène HLA-DQA2. Des analyses de régression logistique conditionnelle identifient un second signal indépendant, près du gène HLA-A. Ces analyses seront répliqués in silico dans les données d’une métaanalyse d’études pangénomiques de CU, ainsi que par génotypage dans une cohorte indépendante de 1090 cas. Nos données confirment l’implication du CMH dans la pathogenèse de la CU et identifie deux signaux indépendantes dans cette région.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 12 mai 2010
host icon Hôte : Université de Montréal

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