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Une méta-analyse d'études d'association pangénomique identifie TAGAP et PUS10 comme loci de susceptibilité communs aux maladies de Crohn et coeliaque

Claudine Beauchamp
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Claudine Beauchamp

Résumé de la communication

Les maladies de Crohn (CD) et coeliaque (CelD) sont des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin montrant une étiologie complexe impliquant des facteurs génétiques et environnementaux. Il a précédemment été montré que trois loci de susceptibilité génétique sont partagés par ces maladies. Le but de notre étude est d’identifier des loci supplémentaires de prédisposition partagés par ces deux maladies. Les résultats d’études d’association pangénomique pour CelD (768 cas, 1422 contrôles) et CD (3230 cas, 4829 contrôles) ont été combinés par méta-analyse. Les 15 régions les plus fortement associées ont été sélectionnées pour une réplication dans des cohortes indépendantes de 3149 cas de CelD et de 1835 cas de CD. Trois loci démontrent clairement des signaux d’association dans la réplication combinée de CelD et CD. Les loci TAGAP et PUS10 montrent une association qui dépasse un seuil de confiance pangénomique de p<5x10-8, tandis que le troisième locus, sur le chromosome 17p13, n’atteint pas ce seuil de confiance. Un quatrième locus, SH2B3, est confirmé comme facteur de risque associé à CelD (p=8.1x10-8) sans montrer d’association à CD. L’analyse combinée de données provenant de deux maladies nous a permis d’obtenir la puissance nécessaire à l’identification des loci de susceptibilité partagés ayant un impact relativement faible sur leur pathogénécité.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 12 mai 2010
host icon Hôte : Université de Montréal

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