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Résumé de la communication
Vers la fin de septembre 2008, des échantillons de tissus de porcelets qui avaient des problèmes cliniques aigues associés au syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRRP) ont été soumis au Service de diagnostic vétérinaire de l'Université de Montréal. Ainsi, plusieurs tests diagnostiques ont été réalisés, y compris un PCR quantitatif en temps réel (mrtqPCR) pour la détection et la différenciation des circovirus porcins (PCV) de génotype 2a et 2b. Les échantillons de porc se sont révélés être positifs pour le PCV2a, mais des résultats inattendus ont été obtenus. Les valeurs de Ct (threshold cycle) obtenues avec les sondes moléculaires du mrtqPCR ciblant les gènes ORF1 et ORF2 du PCV2 ont donnés des résultats suggérant la présence de variations génomiques au niveau du génome viral du PCV2a. Au total, trois cas de diagnostic avec des résultats inhabituels découlant du mrtqPCR ont été étudiés. Après l’isolement viral et des analyses génomiques, un nouveau type de PCV a été identifié. Selon les analyses génomiques, ce nouveau PCV contient les gènes ORF1 du PCV1 et ORF2 du PCV2a, et possède une homologie de séquence nucléotidique de son génome viral entier de 86,4%, 88,7% et 86,5% comparé à celle de souches de références du PCV1, PCV2a et 2b, respectivement. Par conséquent, le nom proposé pour ce nouveau PCV est PCV1/2a. Présentement, la prévalence du PCV1/2a semble être très faible au Québec (2,5% des cas positifs de PCV), et son origine sera débattue.
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