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Développement d'une technique d'hybridation de l'ADN pour la détection des Escherichia coli portant des gènes de virulence et de résistance aux antimicrobiens dans la microflore intestinale du porc

K. Paul Kaboré
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K. Paul Kaboré

Résumé de la communication

L’étude des ''Escherichia coli'' de la flore intestinale des animaux de rente présente un intérêt majeur. Si les ''E. coli'' font partie de la flore commensale, une variété de souches pathogènes peut être présente. La pathogénicité est associée à l’expression génique de facteurs de virulence, et les maladies causées par les ''E. coli'' pathogènes sont alors responsables de pertes économiques majeures. Ces souches virulentes d’''E. coli'' ont le potentiel d’être zoonotiques. La surveillance des gènes de virulence et de résistance aux antimicrobiens des populations d’''E. coli'' s’avère donc très important. L’objectif de cette étude est de développer une technique alternative au PCR et à l’hybridation sur colonies utilisant des sondes radioactives. Pour cela, nous proposons une détection individualisée (HIS), pour chaque cellule bactérienne, de ces gènes grâce à un marquage des sondes à la digoxigenine révélée par la phosphatase alcaline, après filtration de l’échantillon sur des membranes quadrillées hydrophobes (HGMF). La mise au point de la technique cible les gènes ''elt'', ''estB'', et ''faeG'' codant respectivement pour les enterotoxines LT et STb et l’adhésine fimbriaire F4, chez la souche ECL7805. L’HIS HGMF a été appliquée avec succès à des écouvillons rectaux de porcs. Les résultats montrent l’intérêt de cette approche pour étudier les répertoires de gènes de virulence de clones d’''E. coli'', y compris ceux faiblement représentés car elle permet une analyse simultanée de 200 colonies par échantillon.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 14 mai 2010
host icon Hôte : Université de Montréal

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