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Résumé de la communication
Le génome mitochondrial de Diplonema papillatum (diplonémides, groupe sœur des kinétoplastides) a révélé une structure unique au sein des eucaryotes. Les gènes sont fragmentés et chaque morceau est porté par un chromosome différent. Par exemple le gène de la sous-unité 1 de la cytochrome oxydase (cox1) est fragmenté en neuf modules. Les modules sont transcrits individuellement et sont ensuite joints par un processus de «trans-splicing» pour donner l’ARNm de cox1. Pour décrire la fragmentation de cox1 chez les diplonémides et identifier le mécanisme de «trans-splicing», nous avons séquencé tous les modules génomiques de cox1 de trois autres espèces (Diplonema ambulator, Diplonema sp. 2 et Rhynchopus euleeides). Nous constatons que le gène cox1 est fragmenté en neufs modules chez tous les diplonémides. Nos recherches in silico n’ont pas pu reconnaître des séquences cis conservées dans les modules de cox1 au sein de la même espèce ou à travers le groupe qui pouvaient être à l’origine du «trans-splicing». De plus, aucun motif typique pour des introns de groupe I, II, spliceosomal ou d’ARNt en cis n’a été identifié. Il n’y a pas non plus de motifs complémentaires entre des modules adjacents. Nos résultats indiquent un nouveau mécanisme de «trans-splicing» impliquant probablement des facteurs trans (ARN guides ou protéines) dans la mitochondrie des diplonémides.
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