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Problèmes et solutions reliés à l'explosion des données biologiques et à l'absence de standardisation du domaine de la bioinformatique

Alexei Nordell Markovits
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Alexei Nordell Markovits

Résumé de la communication

L'ère post-génomique en sciences de la santé a vu une augmentation exponentielle de la quantité de données informatisées reliées à ces dernières. Le séquençage d'ADN à haut débit, la multiplication des outils et analyses bioinformatiques, ainsi que la création de nouvelles bases de données ayant des vues et classifications nouvelles offrent d'immenses possibilités aux chercheurs. Cependant, aucun standard permettant d'offrir ces données de manière uniforme n'a été créé. Les nouveaux formats et nouvelles bases de données ont souvent une redondance fonctionnelle avec les outils précédents et cette réalité fait qu'il est de plus en plus difficile pour les chercheurs non-spécialistes de retrouver et d'utiliser les données qu'ils ont besoin parmi les centaines de possibilités qui s'offrent à eux. Dans cette présentation, nous offrons une revue des effets néfastes que l'absence de standardisation a sur la recherche et présentons plusieurs exemples concrets où la multiplication des formats de données a causé des problèmes. Nous regardons les efforts qui ont été faits par quelques groupes pour offrir des standards et discutons de la raison pour laquelle ceux-ci n'ont pas abouti à des résultats significatifs. Suite à cette revue des efforts actuels de standardisation, nous concluons à la nécessité de créer un consortium responsable de la gestion de standards des données et offrons une ébauche de celui-ci, basé sur des besoins similaires dans d'autre domaine.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 9 mai 2011
host icon Hôte : Université de Sherbrooke, Université Bishop’s

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