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Étude de la fonction de l’ARN hélicase Dbp4 dans la biogenèse des ribosomes

Soumaya Hachana
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Soumaya Hachana

Résumé de la communication

Dbp4 est une ARN hélicase de la famille «DEAD-box». Cette enzyme nucléolaire est essentielle à la biogenèse des ribosomes de la levure Saccharomyces cerevisiae. L’homologue de Dbp4 chez l’humain (DDX10) serait impliqué dans le cancer du sein. Les protéines «DEAD-box» sont caractérisées par neuf motifs conservés formant le domaine catalytique de l’enzyme; ce domaine est flanqué par des extensions de longueur et composition variables. Nos analyses bioinformatiques suggèrent que l’extension C-terminale de Dbp4 contient un motif d’interaction protéine-protéine «coiled-coil» très conservé. C’est justement cette région de DDX10 qui est mutée dans le cancer du sein. L’extension C-terminale de Dbp4 est essentielle. Afin d’identifier les résidus de cette région qui sont importants pour la fonction de l’enzyme, nous avons utilisé une technique de mutagenèse aléatoire par PCR pour cibler spécifiquement l’extension C-terminale (60 000 clones) et nous avons développé un système génétique qui permet d’identifier les mutants non fonctionnels. Nos résultats préliminaires indiquent que 4% des clones de la banque contiennent des mutations létales. De ce nombre, environ 75% produisent une Dbp4 tronquée. Nous avons entrepris le séquençage des 25% portant des mutations ponctuelles pour déterminer si les mutations se regroupent dans des «hot spots», comme le motif «coiled-coil» par exemple, ou dans des régions phylogénétiquement conservées. Supporté par le CRSNG

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 12 mai 2011
host icon Hôte : Université de Sherbrooke, Université Bishop’s

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