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Le riborégulateur thiB de Escherichia coli : une régulation en trans?

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Maxime Simoneau-Roy

Résumé de la communication

Un riborégulateur est un élément génétique retrouvé dans une région non-codante de certains ARN messagers (ARNm). Celui-ci peut lier directement un ligand spécifique et réguler l’expression des gènes en aval. Le riborégulateur TPP lie la thiamine pyrophosphate, un cofacteur essentiel. Chez ''Escherichia coli'', il existe trois riborégulateurs TPP dont un présent en amont de l’opéron ''thiBPQ''. Selon le modèle actuel, il inhiberait la traduction du gène ''thiB'' en présence de suffisamment de TPP intracellulaire. En 2003, il a été proposé que SroA, un transcrit d’ARN correspondant aux 93 premiers nucléotides de ce riborégulateur, puisse agir comme un petit ARN régulateur. Donc, le riborégulateur ''thiB'' régulerait l’expression de l’opéron ''thiBPQ'' en ''cis'' et d’autres gènes en ''trans''. Mon projet comporte trois volets : le mode de régulation du riborégulateur ''thiB'', la génération de SroA et l’identification de cibles ARNm potentielles. Premièrement, nous avons analysé l’effet du TPP sur l’opéron ''thiBPQ'' par buvardage de type Northern. Suivant l’ajout de TPP, le niveau de l’ARNm diminue rapidement tandis que celui de SroA augmente d’environ 2,5 fois. De plus, le TPP affecte l’expression des fusions ''lacZ'' transcriptionnelles et traductionnelles du riborégulateur, suggérant une régulation plus complexe que prédite. Finalement, nos résultats préliminaires montrent que, lorsque SroA est surexprimé, la quantité détectée de l’ARNm ''psd'' diminue. Ces données suggèrent que le riborégulateur ''thiB'' serait le premier riborégulateur agissant en ''trans'' chez ''E. coli''.

Contexte

section icon Date : 12 mai 2011
host icon Hôte : Université de Sherbrooke, Université Bishop’s

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