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Le Taq Probing™ : une nouvelle méthode de diagnostic moléculaire appliquée à la détection de résistances aux antibiotiques chez Campylobacter jejuni

Patrick Dextras Paquette
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Patrick Dextras Paquette

Résumé de la communication

L’entérocolite à ''C. jejuni'' est la 4e maladie à déclaration obligatoire la plus rapportée au Canada et la 1ère cause d’infections intestinales bactériennes au monde. Le polymorphisme génétique (SNP) est une cause clinique majeure de résistances aux antibiotiques chez cette bactérie. Il s’agit dans ce cas de mutations dans les gènes 23S et ''gyrA'', qui confèrent une résistance à deux antibiotiques utilisés dans le traitement de cette infection. Pour mieux combattre ''C. jejuni'', il faut des outils diagnostiques permettant de détecter ces mutations et dépassant les limitations actuelles des méthodes de laboratoire. Nous avons donc développé une méthode moléculaire (Taq Probing™) pour laquelle nous avons un brevet provisoire. Inspiré du PCR TaqMan™, le Taq Probing™ est un PCR multiplexe utilisant simultanément des sondes fluorescentes complémentaires à la séquence mutante et de type sauvage, des régions d’ADN où se trouvent les mutations. Contrairement au TaqMan™, le Taq Probing™ permet de générer une courbe de dénaturation post-PCR dont le patron dépend de la présence ou non de mutations. Il permet également de détecter des bactéries hétérozygotes et celles porteuses de mutation silencieuse, chose impossible à faire avec les méthodes habituelles. Habile à détecter les variations génétiques au sens large, le Taq Probing™ peut également servir à détecter des SNP modulant la virulence ou la pathogenicité d’un agent infectieux, tout comme des prédispositions génétiques à certains cancers.

Contexte

Section :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
news icon Domaine de la communication :
L'Énoncé de politique des trois Conseils nouvelle version : application au contexte québécois
section icon Date : 12 mai 2011
host icon Hôte : Université de Sherbrooke, Université Bishop’s

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