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Modulation du ribozyme HDV par des aptamères

SR

Membre a labase

Samuel Rouleau

Résumé de la communication

Les riborégulateurs sont des motifs d’ARN qui comprennent un aptamère capable de reconnaitre un métabolite. En présence du métabolite, la structure de l’ARN se modifie ce qui régule l’expression de l’ARN messager. Il a été démontré qu’il est possible de moduler l’activité de certains ribozymes en y greffant des aptamères. Nous avons donc tenter de moduler l’activité du ribozyme HDV grâce à des aptamères en 5’ ou à l’intérieur même du ribozyme qui, en présence d’un métabolite ou d’un autre ARN, changent de conformation et activent ou inhibent le ribozyme. On peut ainsi moduler le ribozyme pour qu’il puisse répondre à des fonctions de logique booléenne telles que «oui », « non », « et », « ou », etc. Nous voulons de plus caractériser ces ribozymes couplés aux aptamères (aptazymes). Pour ce faire, nous avons fait un design rationnel des aptazymes, des analyses cinétiques de coupure in vitro avec des ARNs radiomarqués et des tests in cellulo avec les constructions en 5’ du gène de la luciférase. Nous avons démontré qu’il est possible de moduler le ribozyme HDV avec des aptamères et qu’en combinant plusieurs aptamères, il est possible de créer une cascade complexe d’activation/inactivation et ainsi de moduler l’activité du ribozyme avec plusieurs métabolites en même temps. À long terme, ce système pourrait être utilisé comme outil de détection d’agents pathogènes ou de leur métabolites spécifiques correspondants.

Contexte

section icon Date : 12 mai 2011
host icon Hôte : Université de Sherbrooke, Université Bishop’s

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