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Dynamique de molécules rigides dans un nanoréseau de constrictions

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Antoine Dubé

Résumé de la communication

L'avènement de la photolithographie a ouvert la voie à la construction de nano-réseaux de constrictions, dans le but de remplacer l'électrophorèse sur gel, en offrant la possibilité de construire un système selon les dimensions nécessaires au problème rencontré. Pour notre projet, nous effectuons des simulations numériques de dynamique moléculaire de type Langevin, en suivant le modèle de Kremer et Grest. Nous vérifions d'abord la validité de notre système en reproduisant des résultats connus. Ensuite, nous testons l'hypothèse avancée par Laachi (Laachi et al., PRL, 2007), qui explique que la mobilité plus élevée des molécules plus longues est causée par l'action du moment de force sur les molécules près de l'entrée du canal. Nos résultats montrent que cette hypothèse n'est pas tout à fait vraie. Il est vrai que le moment de force a un rôle, mais pas de la façon présentée par Laachi et al. Selon nos résultats, le moment de force ne devient important que lorsque la molécule est à distance d'interagir avec les parois du système, et non avant son arrivée à l'entrée du canal. De plus, nous avons regardé en plus grand détails les temps de transit dans deux différentes sections du systèmes pour mieux décrire le potentiel de séparation. Ces résultats montrent que les temps varient grandement en fonction du champ électrique : à champs faibles, le temps d'entrée dans le canal domine alors qu'à champs forts, le temps de transport à travers le puits est plus grand.

Contexte

section icon Thème du congrès 2012 (80e édition) :
Parce que j’aime le savoir
news icon Domaine de la communication :
Nature et interactions de la matière
section icon Date : 7 mai 2012

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