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Le microbiome des tonsils du palais mou du porc

JM

Membre a labase

Janet Macinnes : University of Guelph

Résumé de la communication

The tonsil of the soft palate in pigs is a secondary lymphoid tissue that provides a first line of defense against foreign antigens entering by the mouth or nares, but paradoxically, it is also the site of colonization and entry of many bacterial and viral pathogens. Our initial understanding of a limited number of specific microbes present at this site came from culture-based studies. Recently, however, 16S rRNA gene based studies have revealed that Proteobacteria and Firmicutes predominate this site with Actinobacillus, Alkanindiges, Fusobacterium, Haemophilus, Pasteurella, Veillonella, Peptostreptococcus, and Streptococcus making up the majority of reads. In our current studies using T-RFLP analysis, the tonsil microbiome of 128 pigs was evaluated using samples obtained mainly from diseased animals. although it was difficult to obtain unambiguous identification at the genus and species level, it was possible to confirm the predominance of Firmicutes and Proteobacteria and to detect animal to animal differences. Representative samples for pyrosequencing revealed 151 genera across 9 phyla. In contrast to previous 16S rRNA gene studies, the most prevalent genera were Bacteroides, Fusobacterium, Clostridium, Porphyromonas, and Streptococcus. Significant associations were found with community structure and the presence of anemia, abscess, PRRS virus, and Mycoplasma. In the futur, it should be possible to manipulate the microbiome of the tonsil to promote health and reduce disease.

Résumé du colloque

Le microbiote intestinal - mieux connu sous le nom de flore intestinale - est estimé à plus de 100 mille milliards de bactéries, soit dix fois plus que nos propres cellules humaines. Il est de plus en plus reconnu comme un organe à part entière car il est un acteur important de la santé animale. Comme l’ensemble de nos organes, le microbiote intestinal est fonctionnellement dynamique et capable de s’adapter aux différents facteurs environnementaux de l’écosystème intestinal. Il est une barrière contre les infections, il aide au développement et à la maturation du système immunitaire et il contribue à l’extraction des nutriments et de l’énergie des aliments consommés.

Parmi les facteurs à la fois biotiques et abiotiques qui influent sur le microbiote, l’alimentation joue un rôle majeur et peut modifier directement ou indirectement l’environnement gastro-intestinal tout autant que les antibiotiques donnés pour traiter une infection bactérienne. Des déséquilibres au sein de cet écosystème fragile ont même été démontrés dans de nombreuses pathologies. La nutrition aurait donc un rôle important sur la réponse immunitaire face aux maladies infectieuses et sur la composition du microbiote. La perspective d’une maîtrise et d’une orientation de la flore intestinale vers une meilleure efficacité permettrait de mieux valoriser les ressources alimentaires mondiales et assurerait une meilleure rentabilité économique des systèmes d’élevage.

Contexte

section icon Thème du congrès 2013 (81e édition) :
Savoirs sans frontières
section icon Date : 8 mai 2013

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