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Michael Schirm : Caprion
Les biomarqueurs représentent des outils indispensables pour le diagnostic et le dépistage des maladies tel le cancer. Le plasma sanguin est une matrice de choix pour l'identification de biomarqueurs car cet echantillon est facilement accessible et contient non seulement des protéines plasmatiques mais aussi des protéines secrétées de tous les organes et des tissus du corps humain. Nous pouvons utiliser le plasma afin de détecter différents biomarqueurs associés à une maladie ou à un état pathologique. Cependant, la découverte de biomarqueurs dans le plasma est très difficile étant donné l'étendue des concentrations de protéines plasmatiques s'étalant sur plus de 10 ordres de grandeur et la présence de protéines abondantes représentant plus de 90 % de l'échantillon total.
Nous avons développé une approche permettant l'identification de biomarqueurs sécrétées dans le sang en purifiant les protéines contenues a l'intérieur de vésicules de tissus. Celles- ci peuvent par la suite etre analysées dans le sang par LC-MS-MS en mode MRM. Cette approche a permis la quantification de 371 protéines plasmatiques de faible et moyenne abondance a partir d'une analyse de 30 min. Une étude comparative sur des échantillons de plasma provenant de patients atteints de cancer pulmonaire bénin et StageIA (n = 143 ) a permis d'identifier un groupe de 13 protéines permettant la différenciation des nodules pulmonaires bénins a ceux de cancers du poumon à stade précoce.
La spectrométrie de masse est une technologie essentielle dans le domaine des sciences biologiques et de la santé. Cette technologie est entre autres la clé de voûte de la protéomique et de la métabolomique, deux sciences « omiques » qui visent à caractériser l’ensemble des protéines et autres métabolites produits par les cellules dans des conditions physiologiques normales ou pathologiques. Ce symposium vise à faire un survol des plus récents développements en protéomique et en métabolomique, de même qu’un survol de leurs contributions à notre compréhension des processus cellulaires au niveau moléculaire.
La spectrométrie de masse fournit aussi de nouveaux indices sur la structure et la dynamique des protéines et de leurs complexes, systèmes qui très souvent ne sont pas accessibles avec les approches de caractérisation classiques telles que la RMN et l’analyse aux rayons X. Les avancées récentes en spectrométrie de masse structurelle montrent à quel point la mesure de la masse exacte des protéines et de leurs complexes peut offrir une description intégrée de leur composition, de leur dynamique et de leur stabilité.
Thème du colloque :