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Colloque
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Nadia Tahiri : UQAM - Université du Québec à Montréal
L'arbre phylogénétique des espèces est de plus en plus exploité, cependant pour inférer l'arbre, les méthodes traditionnelles ne tiennent compte que de la génétique des espèces étudiées. La question de l'impact de la génétique de ces espèces sur la distribution géographique de ces mêmes espèces peut s'avérer crucial d'autant plus que l'enjeu du changement climatique est un sujet d'actualité. Autrement dit, est-ce que deux espèces très proches génétiquement sont-elles nécessairement proches géographiquement? Dans notre étude, nous tenterons de corréler la distribution actuelle des espèces par: 1) leurs structures protéiques et 2) leurs caractéristiques climatiques. Nous calculerons informatiquement les matrices de dissimilarité pour les paramètres climatiques (e.g. la température, la pression et le taux d'humidité) et pour les séquences génétiques utilisées. À partir de ces matrices de dissimilarités ainsi obtenu, nous inférons leurs arbres reflétant leurs génétiques et leurs distributions climatiques. Nous utiliserons pour notre étude un ensemble de 52 carnivores vivant en Amérique du nord, plus spécifiquement le Canada, les USA et le Mexique. Un des enjeux majeurs à cette étude est d'optimiser notre algorithme afin que celui-ci puisse prendre en considération un grand jeu de données. Pour y parvenir, nous utiliserons différents clusters (i.e. Calcul Québec) en parallélisant l'algorithme. Nous innoverons par notre stratégie de haute performance et l'exploration des réseaux.
Ce colloque porte sur l’importance du calcul informatique de pointe (CIP) pour le Québec. Dans des domaines comme la dynamique des fluides, la physique ou la chimie numérique, le CIP joue un rôle prépondérant depuis plusieurs décennies et permet par exemple de concevoir des avions plus silencieux et économes. L’utilisation du CIP s’est cependant fortement diversifiée dans les dernières années. On l’utilise pour assurer l’efficacité énergétique de nos entreprises ou encore pour mieux comprendre la diversité des interactions entre les espèces et leurs relations complexes avec l’environnement. En santé, le développement de médicaments s’est grandement accéléré grâce à la modélisation et à la simulation de la dynamique des interactions moléculaires alors que le décodage du génome ouvre la porte à une future médecine personnalisée. En sciences humaines et sociales, on l’utilise pour comprendre les mécanismes de la perception de l’environnement acoustique, pour préparer des archives et des bibliothèques musicales ou pour procéder à l’analyse de textes à grande échelle. Finalement, un autre secteur où le CIP joue un rôle grandissant est l’exploration et l’exploitation de vastes banques de données numériques, que ce soit pour l’étude des médias sociaux ou pour la prise de décision en temps réel. Plusieurs des thèmes mentionnés ci-dessus feront l’objet de présentations lors de notre colloque.
Nous aurons également deux tables rondes qui permettront de discuter du rôle du CIP en dehors des sphères universitaires. Les thèmes abordés sont : les ressources de calcul informatique de pointe et la formation : un enjeu pour le Québec et l’entrepreneuriat de demain : l’innovation et le numérique. Ces tables rondes seront suivies par une session d’affiches où les étudiants faisant appel aux ressources de Calcul Québec présenteront leurs travaux.
Thème du congrès 2017 (85e édition) :
Thème du colloque :
Date :
8 mai 2017
Titre du colloque :
Responsables :
