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Colloque
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Alexandra Doyon : UQTR- Université du Québec à Trois-Rivières
La connaissance fine de la dynamique des marqueurs liés au sexe, soit ceux situés sur les chromosomes X et Y et sur l’ADN mitochondrial dans une population est essentielle à plusieurs domaines de la génétique. L’estimation des fréquences de certains marqueurs à fine échelle spatiale demeure cependant un défi, car ces fréquences sont sensibles à la dérive génétique et aux effets fondateurs. Des modèles combinant des données généalogiques et moléculaires peuvent permettre de surpasser les limites associées aux échantillons limités afin d’obtenir une estimation fiable des fréquences. Ces modèles permettent de démultiplier un échantillon restreint de profils génétiques pour obtenir une couverture beaucoup plus grande de la population. Nous avons ainsi déterminé si les fréquences des haplotypes pour le chromosome Y ont changé dans le temps et l’espace pour la population canadienne-française du Québec entre 1608 et 1960 à l’aide de tels modèles. Pour ce faire, nous avons attribué des haplotypes Y à travers la généalogie à partir des individus génotypés vivants aujourd’hui. Cela a nécessité un grand nombre de calculs et de traitements sur un jeu de données comprenant plus de 4 millions d’individus. De nombreux défis se posent à un tel jumelage dont la mesure du taux de paternité extra-conjugale et des taux de mutation. Les premières conclusions sur la variation spatio-temporelle des fréquences haplotypiques dans la population canadienne-française seront présentées.
Ce colloque porte sur l’importance du calcul informatique de pointe (CIP) pour le Québec. Dans des domaines comme la dynamique des fluides, la physique ou la chimie numérique, le CIP joue un rôle prépondérant depuis plusieurs décennies et permet par exemple de concevoir des avions plus silencieux et économes. L’utilisation du CIP s’est cependant fortement diversifiée dans les dernières années. On l’utilise pour assurer l’efficacité énergétique de nos entreprises ou encore pour mieux comprendre la diversité des interactions entre les espèces et leurs relations complexes avec l’environnement. En santé, le développement de médicaments s’est grandement accéléré grâce à la modélisation et à la simulation de la dynamique des interactions moléculaires alors que le décodage du génome ouvre la porte à une future médecine personnalisée. En sciences humaines et sociales, on l’utilise pour comprendre les mécanismes de la perception de l’environnement acoustique, pour préparer des archives et des bibliothèques musicales ou pour procéder à l’analyse de textes à grande échelle. Finalement, un autre secteur où le CIP joue un rôle grandissant est l’exploration et l’exploitation de vastes banques de données numériques, que ce soit pour l’étude des médias sociaux ou pour la prise de décision en temps réel. Plusieurs des thèmes mentionnés ci-dessus feront l’objet de présentations lors de notre colloque.
Nous aurons également deux tables rondes qui permettront de discuter du rôle du CIP en dehors des sphères universitaires. Les thèmes abordés sont : les ressources de calcul informatique de pointe et la formation : un enjeu pour le Québec et l’entrepreneuriat de demain : l’innovation et le numérique. Ces tables rondes seront suivies par une session d’affiches où les étudiants faisant appel aux ressources de Calcul Québec présenteront leurs travaux.
Thème du congrès 2017 (85e édition) :
Thème du colloque :
Date :
8 mai 2017
Titre du colloque :
Responsables :
