Colloque

Le bruit du silence : transcription du génome répétitif dans les gliomes H3K27M à la résolution de cellule unique

Claudia Kleinman

Membre a labase

Claudia Kleinman : Université McGill

Résumé de la communication

Les gliomes de haut grade sont une cause majeure de décès liés au cancer chez les enfants et les jeunes adultes. L’altération de gènes de la chromatine, ainsi que la dérégulation de l'épigénome qu’elle entraine, est à la base de cette maladie. Une mutation somatique dans les variantes de l'histone 3 (H3K27M) est l’altération la plus fréquente et entraîne à la fois une perte globale de la modification d’histone répressive H3K27me3 et une augmentation globale de la modification activatrice H3K27ac. Ceci mène à une dé-répression générale du génome, dont certains éléments qui sont normalement silencieux : les éléments répétitifs, les retrotransposons et les ARN non codants. L'ampleur de cette dé-répression et ses effets sur la cellule restent encore peu connus.

Cette présentation porte sur une caractérisation de l'expression des éléments répétitifs et des ARN non codants dans les tumeurs cérébrales pédiatriques à la résolution de cellule unique, ainsi que les réponses cellulaires qu’elle suscite. En combinant le séquençage d'ARN de noyaux uniques (sn) ou de cellules uniques (sc) avec le séquençage snATAC, nous avons identifié des gradients d'expression intratumorales. Ces gradients corrèlent avec signatures des cibles du complexe de méthylation répressif PRC2, ainsi que avec le degré de différentiation des cellules. Nous terminerons avec une discussion sur les réponses déclenchées par les cellules pour atténuer les effets délétères d’une expression dérégulée du génome silencieux.

Résumé du colloque

Le colloque proposé s’intéresse à de nombreuses questions liées à la biologie des ARN, notamment la transcription, l’épissage, la maturation et la dégradation des ARN. La fonction de plusieurs types d’ARN non codants tels que les micro-ARN ou les petits ARN nucléolaires (snoARN) sera aussi abordée. En plus d’aborder des questions fondamentales, le colloque abordera le rôle des ARN et des protéines liant les ARN dans certaines maladies humaines grâce à des projets de recherche sur la biologie des tumeurs et des maladies infectieuses.