Veuillez choisir le dossier dans lequel vous souhaitez ajouter ce contenu :
Colloque
Membre a labase
Marc-André Bossanyi : Université de Sherbrooke
Prédire efficacement la structure secondaire commune de séquences d’ARN homologues est cruciale pour comprendre les fonctions des ARN non codants, leur influence sur la santé humaine. Dans les dernières années, de nombreuses méthodes ont été développées pour prédire la structure secondaire de familles d’ARN. Il existe trois types d’approches. L’approche 1) « aligner-et-replier » consiste à calculer simultanément l’alignement et le repliement des ARN. L’approche 2) comporte les méthodes de type « aligner-puis-replier » ou « replier-puis-aligner » qui calculent l’alignement et le repliement en deux étapes séparées, le résultat de la première étape étant utilisé dans la seconde étape. L’approche 3) « replier-sans-aligner » consiste à prédire la structure secondaire des ARN sans aligner les séquences. Cette approche est basée sur l’exploration d’un espace de structures secondaires proches du repliement optimal et sur la détermination des éléments structuraux conservés dans la famille d’ARN. L’approche « aligner-et-replier » est la plus fiable pour inférer une structure secondaire d’ARN précise, mais elle est aussi très coûteuse en temps. L’approche « replier-sans-aligner » a l’avantage d’être la plus efficace en temps tout en prédisant assez fiablement les structures secondaires d’ARN. Nous présentons la méthode aliFreeFoldMulti permettant de prédire la structure secondaire de toutes les séquences d’une famille d’ARN homologues en utilisant une approche « replier-sans-aligner ».
Le colloque, organisé par le CIRIUS, le Centre interdisciplinaire de recherche en informatique de la santé de l’Université de Sherbrooke, souligne l’émergence d’un pôle d’excellence en informatique de la santé, ainsi que le lancement du réseau Ensemble.
Des chercheurs, des étudiants, des citoyens, des professionnels de la santé, des décideurs et des entrepreneurs joignent leurs efforts pour améliorer la santé des citoyens.
Les systèmes de santé font face à des défis sur le plan des coûts, de l’efficience, des délais et de l’amélioration continue de la qualité des soins. Cette situation exige de prendre en considération la diversité : des institutions et des normes; des infrastructures et des systèmes d’information; des milieux de pratique et de recherche; et des déterminants de santé.
Pour améliorer les soins, les systèmes de santé apprenants tirent profit de la pratique clinique et de la recherche pour produire des connaissances qui sont réintégrées dans le système de soins. Ainsi, les cliniciens adaptent leurs pratiques en fonction des nouvelles connaissances, prennent des décisions éclairées, s’appuient sur les pratiques exemplaires et revoient leurs processus. Ils ont accès aux bonnes données de santé, au bon moment, et les patients reçoivent des soins de qualité adaptés à leurs conditions et en temps opportun.
Défis
Or, l’accès aux données de santé est difficile. Cela est attribuable aux données fragmentées et hétérogènes, au cadre légal ainsi qu’aux coûts et aux délais pour avoir accès aux données. Les enjeux liés à la sécurité des données sont aussi inéluctables.
Par ailleurs, les citoyens doivent pouvoir jouer un rôle central au sein des systèmes de santé apprenants. Ils doivent pouvoir consentir de manière informée à l’utilisation de leurs données de santé pour la recherche. Cela pose des questions éthiques essentielles à propos de la faisabilité et de l’acceptabilité de nouveaux modes de consentement.
Les grands défis portent donc sur : 1) l’infrastructure technologique et sociale (y compris la cybersécurité et la participation citoyenne); 2) l’analyse des données pour mieux comprendre les individus et le système de santé (y compris les approches d’apprentissage machine); et 3) la science derrière la sélection, l’évaluation et l’implantation des nouveaux outils provenant de la recherche pour améliorer les soins de nos concitoyens. Le CIRIUS est particulièrement bien positionné pour y répondre efficacement.
Réseau Ensemble : les maladies rares au cœur d’un système de santé apprenant
Le colloque est l’occasion de lancer le réseau Ensemble, un projet transatlantique codirigé par la Pre Anita Burgun, de l’Université de Paris, et le Pr Jean-François Éthier, de l’Université de Sherbrooke. Le réseau Ensemble combinera la recherche, la pratique clinique et le transfert des connaissances pour faire face aux maladies rares.
Le colloque pose ainsi les fondations d’une vision commune et internationale pour les systèmes de santé apprenants de demain. Soyez des nôtres!
Thème du congrès 2021 (88e édition) :
Thème du colloque :
Date :
5 mai 2021
Titre du colloque :
Voir la présentation Slideshare
Responsables :
