Colloque

Simulation des interactions entre le nanotube de carbone d’un biocapteur à effet de champ et le G-quadruplex

Laura Luna Bédard

Membre a labase

Laura Luna Bédard : Cégep de Saint-Jérôme

Résumé de la communication

Les biocapteurs à effet de champ sont des dispositifs ultra miniaturisés qui permettent de détecter et d’analyser la cinétique des biomolécules en temps réel. Considérant que les interactions entre le biocapteur et la biomolécule sont au cœur de l’utilisation du dispositif, je parlerai du projet qui vise à appuyer les efforts expérimentaux pour améliorer leur compréhension. Par l’utilisation de simulations, ma recherche veut contribuer à la proposition de stratégies permettant de parfaire la sensibilité du biocapteur. Plus particulièrement, le biocapteur étudié est formé d’un nanotube de carbone traversé par un courant. Il est lié de manière covalente à une biomolécule par un composé intermédiaire. Lorsque la configuration de la biomolécule change, son potentiel électrostatique près de la liaison varie. L’expérience suggère que cette variation est la cause du changement de la conductance du nanotube. Pour appuyer l’expérience, j’utilise des simulations de dynamique moléculaire et d’échange de répliques Hamiltonienne afin d’analyser les interactions entre le G-quadruplex et le nanotube de carbone. L’étude de la trajectoire, de la stabilité et du potentiel électrostatique de la biomolécule ainsi que celle de sa proximité et de ses contacts avec le nanotube de carbone lors des simulations tracent un portrait du comportement du système.

Résumé du colloque

Alors que les sciences et les technologies connaissent un fulgurant développement et que l’économie s’appuie de plus en plus sur le savoir, la découverte et la préparation de la relève scientifique commencent à un âge de plus en plus précoce. Mais, malgré le fait que de nombreux étudiants et étudiantes du collégial mènent des activités de recherche depuis plusieurs années, ces réalisations ne sont pas encore suffisamment connues, et encore moins reconnues et valorisées. Ces dernières années et à l’occasion d’éditions récentes du congrès de l’Acfas, à Montréal en 2016, et dans l’Outaouais en 2019, on a mis sur pied deux colloques sur l’engagement des étudiants et étudiantes dans les recherches menées, au sein des collèges, dans le secteur des sciences naturelles et du génie. En plus de discuter des contraintes et des pistes de solutions pour améliorer l’encadrement, ces deux colloques visaient à diffuser et à faire connaître les résultats de travaux de recherche. Le colloque de 2022 s’inscrit dans la continuité logique des deux précédents et vise à pérenniser l’événement en offrant une tribune pour que les étudiants et étudiantes puissent présenter leurs travaux. Il sera désormais organisé régulièrement, annuellement ou biannuellement.