Colloque

Pathogénicité, résistance aux antibiotiques et activité inhibitrice dans les isolats de Clostridium perfringens provenant de volailles touchées par l'entérite nécrotique au Canada.

Sara García-Vela

Membre a labase

Sara García-Vela

Résumé de la communication

INTRODUCTION
L'entérite nécrotique (EN) causée par Clostridium perfringens est l'une des maladies les plus communes de la volaille et entraîne une perte économique énorme pour l'industrie avicole. Pour une meilleure compréhension de cet agent pathogène, des études impliquant la détection des mécanismes de résistance aux antimicrobiens ainsi que la pathogénicité sont nécessaires, ainsi que d'autres caractérisations comme la capacité à produire des bactériocines qui inhibent la prolifération des bactéries commensales dans le tractus intestinal de la volaille, permettant à cet agent pathogène de s'établir et de proliférer. L'objectif de cette étude était de caractériser par séquençage du génome entier (WGS) une collection d'isolats de C. perfringens provenant de volailles affectées par le NE en mettant l'accent sur la production de composés antimicrobiens, la détection des mécanismes de résistance aux antimicrobiens et la pathogénicité.
MÉTHODOLOGIE
A cette fin, une collection de 20 souches de C. perfringens a été envoyée à WGS avec la technique illumina et analysée avec plusieurs outils bioinformatiques. Le phénotype de résistance antimicrobienne a été étudié par microtitration et la production de composés antimicrobiens a été étudiée par diffusion en puits d'agar.
RESULTATS
Des gènes de résistance antimicrobienne ont été trouvés dans 16 échantillons, les gènes tet, liés à la résistance à la tétracycline, étant les plus fréquents. Il est intéressant de noter que deux isolats portaient le gène erm(T) pour la résistance aux macrolides, ce qui a été détecté pour la première fois chez C. perfringens. Ainsi, les mutations sur le gène et ses environnements génétiques ont également été étudiés. Toutes les souches portaient différents facteurs de virulence et toxines. Les relations phylogénétiques ont montré une grande variabilité entre les souches et de nouvelles combinaisons de gènes de ménage ont été repérées. Les résultats de la détection des bactériocines sont encore en cours.
CONCLUSION
En conclusion, l'analyse WGS permet de mieux comprendre les caractéristiques génomiques des bactéries et constitue un outil prometteur pour l'étude et une meilleure compréhension de l'agent pathogène aviaire C. perfringens. La production de composés antimicrobiens par C. perfringens offre également de nouvelles perspectives car elle n'a pas été envisagée dans les études précédentes.

Résumé du colloque

200- Sciences naturelles, mathématiques et génie. Caractérisation du risque alimentaire associé à l'interface ferme et transformation primaire dans une approche de la ferme à la table. Un total de 4 millions de Canadiens sont touchés par une maladie d’origine alimentaire (TIA) chaque année. Parmi ces cas, on compte environ 11 600 hospitalisations et 238 décès. Les TIA sont causées par des microorganismes (bactéries, virus et parasites) provenant des produits d'origine animale, des fruits et légumes frais ou de l'eau potable et cette contamination peut survenir à n'importe quel maillon de la chaîne alimentaire. La salubrité alimentaire est donc mieux assurée par une approche intégrée qui prend en compte l'ensemble de cette chaîne. Un système de sécurité sanitaire des aliments doit ainsi tenir compte de la complexité de la production alimentaire, de la mondialisation de l'approvisionnement et doit être fondé sur une juste appréciation des risques sanitaires pour le consommateur. Parmi ceux-ci, le développement et la propagation de la résistance aux agents antimicrobiens est considéré de la plus haute importance par les autorités de santé publique. Or, le secteur de la production animale est considéré comme l'un des principaux vecteurs de la propagation de la résistance bactérienne aux antibiotiques. Cependant, les études les plus récentes suggèrent que les animaux d’élevage contribuent relativement peu à l'acquisition de bactéries résistantes par les humains. Néanmoins, dans une perspective de production animale durable, et indépendamment de l’ampleur de l’implication de ce secteur dans la dissémination de la résistance aux antimicrobiens à travers la chaîne alimentaire, plusieurs actions ont été menées en production animale afin de limiter cette résistance bactérienne et préserver l'efficacité et la longévité des antibiotiques. En revanche, l’utilisation d’agents antimicrobiens est encore aujourd’hui parfois indispensable pour prévenir l’exposition de l’humain aux pathogènes zoonotiques alimentaires, que ce soit en production animale ou dans les établissements de transformation.