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Colloque
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Jerome Waldispuhl : Université McGill
Les acides ribonucléiques (ARN) constituent une vaste classe, encore largement sous-exploitée, de cibles pharmaceutiques. À-ce-jour, nous estimons que jusqu'à 70 % de notre génome encode des ARNs, ce qui ouvre un champ immense de nouvelles possibilités. Toutefois, en raison du nombre colossal de petites molécules, le développement de méthodes informatiques capable d’identifier efficacement les candidates les plus prometteuses est essentiel. Traditionnellement, cette recherche s’appuie sur la disponibilité de structures tri-dimensionnelles de bonne qualité, mais cette information est relativement rare pour les ARNs.
Les progrès récents des technologies d'apprentissage automatique offrent de nouvelles opportunités pour repenser le pipeline de découverte de médicaments ciblant l'ARN. Dans cette présentation, je montre comment une représentation des structures d’ARNs sous la forme d’un graphe d’interactions de paires de bases non-canoniques (i.e., Au-delà des paires de bases canoniques Watson-Crick et Wobble) peut nous permettre de mieux tirer parti des algorithmes d’apprentissage pour améliorer (i) la précision des méthodes de prédiction de la structure 3D, et (ii) l'efficacité des programmes de calcul des outils d'amarrage. Cette approche a pour vocation de compléter les outils déjà disponibles et accélérer la recherche de nouveaux médicaments.
La biologie structurale est un domaine de la recherche en biologie qui étudie l’organisation et le fonctionnement des mécanismes biologiques et de ses constituants, à l’échelle atomique. Ces mécanismes incluent autant ceux impliqués dans les fondements du vivant (transcription et réparation de l’ADN, traduction génétique, respiration cellulaire, autophagie) que ceux impliqués dans diverses pathologies (maladies infectieuses, cancers, vieillissement, dérèglements génétiques). Il est remarquable que les mécanismes biologiques reposent sur les fonctions d’un nombre limité de types de macromolécules naturelles, principalement les protéines, les acides nucléiques, les sucres et les lipides, et sur leurs interactions. Ainsi, la biologie structurale s’intéresse à examiner en trois dimensions à l’échelle atomique la complexité et la diversité de ces différents types de macromolécules biologiques et leur fonctionnement.
Ce volet des sciences fondamentales en médecine utilise une grande variété de techniques biophysiques pour visualiser les molécules du vivant et mieux comprendre leur fonctionnement, telles la résonance magnétique nucléaire (RMN), la cristallographie aux rayons X, la diffusion de rayons X aux petits angles (SAXS) et la cryo-microscopie électronique (cryo-EM). Grâce à cette instrumentation de pointe, la recherche en biologie structurale permet de faire des découvertes importantes sur la base atomique et moléculaire des phénomènes biologiques et de faire progresser les connaissances sur le rôle des macromolécules biologiques dans les nombreuses pathologies infligeant le vivant.
Notre colloque sert de vitrine pour mettre de l’avant les récentes découvertes en ce sens où des scientifiques d’ici et d’ailleurs ayant démarré leur programme de recherche indépendant dans les dernières années présentent leurs recherches. Des présentations orales et par affiches offertes par des étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs ainsi que par des stagiaires postdoctoraux complètent le programme.
Thème du congrès 2023 (90e édition) :
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Date :
12 mai 2023
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