pen icon Communication
quote

Analyse et modélisation des données métagénomiques en écologie microbienne

TA

Membre a labase

Talagbe Gabin Akpo : INRS - Institut national de la recherche scientifique

Résumé de la communication

L'exploitation des sables bitumineux est associée à une importante production d'acide naphténique (AN), qui est un produit nocif pour l’environnement. En effet, la présence de l’AN provenant de la biodégradation du pétrole, altère la qualité de l'eau et engendre une modification importante des écosystèmes aquatiques. Ainsi, il est primordial de trouver des solutions pour réduire son impact néfaste sur l’environnement. Dans notre présentation, nous faisons part des résultats des analyses de données métagénomiques de plusieurs millions de gènes provenant des sables bitumineux afin d’évaluer le pouvoir protecteur des plantes CAREX aquatilis à réduire le taux d’AN dans l’eau. Les données génomiques présentent à la fois une variabilité plus importante que la moyenne avec une forte présence de zéro. L’étude des liens entre la concentration d’acide naphténique et les données métagénomiques est rarement mise avant, mais prometteuse pour comprendre les mécanismes moléculaires. Nous présenterons explicitement les détails de l’expérience de cette étude et les défis associés à l’analyse de ces données volumineuses en passant par les méthodes d'apprentissage machine. Ensuite nous présenterons nos résultats finaux de la première étape et nous discuterons des prochaines étapes.

icône du bouton Visionner la contribution

Contexte

section icon Thème du congrès 2024 (91e édition) :
Mobiliser les savoirs en français
news icon Domaine de la communication :
Environnement
section icon Date : du 13 au 17 mai 2024

Découvrez d'autres communications scientifiques

news icon

Thème du communication :

Environnement

Autres communications du même congressiste :

news icon

Domaine de la communication :

Environnement