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Amplification et séquençage des ADNr chez les Betulaceae: relations phylogénétiques au niveau de l'ITS

Louise Savard
Peng Li
Martin Michaud
Jean Bousquet
LS

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Louise Savard

Résumé du colloque

La détermination rapide de séquences d'ADN a récemment permis une amélioration de notre habileté à reconstruire les phylogénies et répondre aux questions reliées à la spéciation et l'évolution. Conséquemment, nous avons entrepris d'isoler une région du génome nucléaire suffisamment conservée mais aussi variable afin de préciser les relations phylogénétiques au sein de la famille des Betulaceae et aussi à l'intérieur des genres Alnus et Betula. Des marqueurs spécifiques permettant d'amplifier la région intergénique transcrite (ITS) de l'unité ribosomique ont été synthétisés et utilisés pour amplifier par réaction de polymérisation en chaîne cette région chez les genres Alnus, Betula, Carpinus, Corylus, et Ostrya, de même qu'au niveau des sous-genres au sein d'Alnus et de sections du genre Betula. Nous avons pu démontrer, grâce à des séquences ITS-1 et ITS-2 provenant de deux taxons, dont une située dans une sous-unité ribosomique, et l'autre située dans une région conservée proximale du gène codant pour la grosse sous-unité ribosomique. Aucun polymorphisme à l'intérieur au sein de même genre n'a pu être remarqué. Les produits d'amplification ont par la suite été soumis avec succès à une amplification asymétrique et des séquences à l'aide de mêmes amorces et deux amorces additionnelles situées aux extrémités opposées du gène pour fournir 585. Les séquences obtenues furent alignées et les taux de substitution calculés. Ces derniers démontrent une hétérogénéité lors comparées avec ceux obtenus pour quelques plantes annuelles. Les arbres phylogénétiques obtenus par analyse de parcimonie et analyse de distances étaient généralement en accord avec ceux dérivés de l'analyse de caractères morphologiques, isoenzymatiques, ou séquences de gènes chloroplastiques.

Contexte

Section :
Botanique et écologie végétale
news icon Thème du colloque :
Botanique et écologie végétale
host icon Hôte : Université de Sherbrooke

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Titre du colloque :

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