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Analyse des séquences nucléotidiques de la séquence "leader" de plusieurs souches du virus de l’artérite équine (VAE)

Ali Kheybar
Gilles St-Laurent
Nathalie Lepage
Julie Dufresne
Denis Archambault
AK

Membre a labase

Ali Kheybar

Résumé du colloque

Le génome du VAE, un artérivirus pouvant causer des avortements chez les juments gestantes, est un ARN simple brin de polarité positive polyadénylé d’environ 12,7 kb. Six ARN subgénomiques possédant une séquence "leader" commune dérivée de l’extrémité 5’ du génome viral, sont produits pendant la réplication virale. L’association à la virulence de la séquence "leader", qui est une région non codante, a été démontrée chez d’autres virus à ARN simple brin positifs. Dans cette étude, la séquence "leader" de plusieurs isolats du VAE dont le pouvoir abortif est variable a été analysée. Des copies d’ADNc de la séquence "leader" de 10 isolats ont été obtenues par transcription inverse-PCR puis clonées et séquencées. L’analyse de ces séquences a révélé un haut degré d’homologie entre les isolats du VAE incluant la souche de référence Bucyrus. Cependant, plusieurs substitutions nucléotidiques (transitions et transversions) ainsi que des insertions ont été observées. De plus, l’analyse des prédictions des structures secondaires des séquences "leader" a révélé une différence entre les souches abortives et les souches non abortives. La signification biologique de ces différences reste à être déterminée.

Contexte

Section :
Biochimie, biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biochimie, biologie moléculaire
host icon Hôte : Université du Québec à Chicoutimi

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Titre du colloque :

Biochimie, biologie moléculaire
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