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Analyse différentielle des transcriptomes de bivalves bioindicateurs exposés à des contaminants organiques

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Jean-Michel Danger

Résumé du colloque

Dreissena polymorpha, pour les milieux dulcicoles, Mytilus edulis et Mya arenaria, pour les zones estuariennes et côtières, sont des bivalves largement utilisés dans les programmes de biosurveillance de la qualité de l'environnement. Les mécanismes d'adaptation et de résistance à la contamination d'origine anthropique de ces organismes sont assez mal cernés. Nous avons développé des approches en systèmes ouverts d'analyse de l'expression génique afin d'identifier des acteurs moléculaires impliqués dans la réponse aux stress chimiques chez ces bivalves. Cette stratégie est fondée sur l'analyse différentielle des transcriptomes par construction de banques soustractives par « Suppressive PCR Subtractive Hybridization » (SSH). Chez Dreissena polymorpha, cette analyse a été conduite après expositions, en milieu contrôlé, à l'atrazine, à un mélange Aroclor 1254/3-methyl-cholantrène et au chrysène. Un total d’environ 450 transcrits indépendants, candidats à une expression différentielle, a été isolé. Ces messagers codent pour des protéines impliquées dans de grandes catégories fonctionnelles comme la machinerie traductionnelle, les systèmes de réplication, d'expression et de réparation du génome, la construction du cytosquelette ou de la matrice extracellulaire, et l'apoptose ou la prolifération cellulaire. Chez Mytilus edulis l'analyse de l'effet de l'atrazine sur différents tissus a permis d'isoler des centaines de clones dont une partie a été séquencée. Des transcrits candidats à l'expression différentielle communs à Dreissena polymorpha et Mytilus edulis ont cependant pu être identifiés. Chez Mya arenaria, une stratégie similaire est actuellement conduite sur les gonades d'individus mâles et femelles exposés au tributylétain. Des macropuces à ADN construites à partir des transcrits isolés sont testées. Elles constituent des outils permettant de déterminer les caractéristiques de régulation de l'expression génique par les xénobiotiques qui pourraient, après validation, être utilisés dans des programmes de biosurveillance.

Contexte

manager icon Responsables :
Stéphane Pillet
host icon Hôte : Université du Québec à Montréal

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