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Analyse structurelle de la tête polaire du ganglioside G0a en présence d'ions divalents par RMN-2D

Yves Aubin
James H. Prestegard
YA

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Yves Aubin

Résumé du colloque

L'hexasaccharide Neu5Ac α(2→3)Gal β(1→3)GalNAc β(1→4)[Neu5Ac α(2→3)]Gal β(1→4)Glc constituant la tête polaire du ganglioside G0a est analysé par une série d'expériences RMN-2D (HOHAHA, HMQC et HMBC) pour obtenir l'assignation complète des déplacements chimiques des 1H et des 13C dans le but de déterminer sa structure tri-dimensionnelle en solution en présence d'ions divalents. Pour ce faire, l'expérience COSY-T1 accordon a été appliquée en utilisant le Mn2+ paramagnétique comme substitut au Ca2+ présent dans les systèmes biologiques. Le remplacement du Ca2+ avec le Mn2+ provoque une augmentation du taux de relaxation (T1), ce dernier étant relié à la distance iron-proton par un facteur de 1/r6. L'information tirée des variations des temps de relaxations permet de calculer des distances ion-proton de l'ordre de 3.0 à 9.0 qui sont utilisées comme contraintes dans le modèle de mécanique moléculaire AMBER pour raffiner la structure de G0a-OS en solution.

Contexte

Section :
Résonance magnétique nucléaire : une technique aux multiples applications
news icon Thème du colloque :
Résonance magnétique nucléaire : une technique aux multiples applications
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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