Colloque

Analyses phylogénomiques des mammifères par points de cassure et par rearrangements

Zaky Adam

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Zaky Adam

Résumé du colloque

La reconstruction des génomes des espèces ancestrales dépend de la critère d'optimisation de l'algorithme phylogénétique. Deux critères qui tiennent compte de l'ordre de gènes sur les chromosomes sont les points de cassure et le nombre de réarrangements. Sans évidence directe des génomes ancestraux, il est difficile à évaluer la quelle des deux méthodes est supérieure. Certes, les arbres phylogénétiques construits selon les points de cassures sont les meilleurs sous cette critère et l'affirmation analogue tient bien par rapport aux arbres de réarrangements. Notre suggestion pour une comparaison juste est d'évaluer les arbres construits selon chaque méthode par la critère de l'autre méthode. En appliquant ce test à des données sur des espèces mammifères et aux données simulées, nous trouvons que les reconstructions par réarrangement sont mieux évaluées par la critère de cassures que les reconstructions par point de cassures le sont par la critère de réarrangements.