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Caractérisation de la protéine ns2 du coronavirus humain OC43

Patrick Labonté
Samir Mounir
Pierre J. Talbot
PL

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Patrick Labonté

Résumé du colloque

Les coronavirus humains (HCV) sont responsables principalement d'infections respiratoires. Nous avons cloné et séquencé la région située en amont du gène HE de HCV-OC43. Cette région représente un cadre de lecture ouvert de 847 nucléotides codant possiblement une protéine non-structurale de 32,2 kDa (ns2). La séquence intergénique UCUAAAC est présente 15 nucléotides en amont de ce gène et le codon d'initiation de la traduction est dans un contexte favorable. La séquence de ns2 contient six sites potentiels de phosphorylation. La comparaison de la séquence en acides aminés de ns2 de HCV-OC43 avec celle du coronavirus entérique bovin (BCV) montre une identité de 92%. Cependant, une différence importante est observée entre HCV-OC43 et BCV au niveau de cette protéine. Elle consiste en la variation de 9 acides aminés consécutifs. Ces derniers sont hydrophobes chez BCV mais moyennement hydrophiles chez HCV-OC43, modifiant probablement la structure de la protéine. Afin d'analyser l'expression in vivo de la protéine ns2, ainsi que son implication possible dans la structure du virus, des expériences d'immunofluorescence et d'immunoprécipitation seront réalisées à l'aide d'un anticorps polyclonal.

Contexte

Section :
Biochimie, biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biochimie, biologie moléculaire
host icon Hôte : Université du Québec à Rimouski

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Titre du colloque :

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