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Caractérisation des conversions géniques dans le génome humain.

Guy Drouin
David Benovoy
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Guy Drouin

Résumé du colloque

Nous avons utilisé la méthode GENECONV pour caractériser les conversions géniques qui se sont produites entre les gènes du génome humain qui codent pour des protéines et qui font parti des 1 434 familles multigéniques ayant plus de deux gènes. Les conversions géniques se produisent à une fréquence de 0.88 % et ont une longueur moyenne de 371 paires de bases. La taille et la fréquence des conversions sont corrélées avec la similarité des séquences impliquées dans ces conversions. La fréquence des conversions et le taux de recombinaison sont aussi corrélés. Les conversions intrachromosomiques sont presque 5 fois plus fréquentes que les conversions interchromosomiques et les conversions intrachromosomiques sont plus fréquentes entre gènes plus proches les uns des autres. Toutefois, ces fréquences plus élevées sont le résultat du fait que la majorité des gènes dupliqués du génome humain sont près les uns des autres. La longueur moyenne des conversions est plus petite lorsqu’elles chevauchent un intron. Ceci suggère que le plus bas niveau de similarité des séquences introniques limite la taille des conversions des gènes humains. L’excès de conversions dans la partie 3’ des gènes humains suggère que des séquences d’ADN complémentaire sont souvent impliquées dans des événements de conversions géniques avec leurs copies chromosomiques.

Contexte

Section :
Bioinformatique, génomique, épigénétique
news icon Thème du colloque :
Bioinformatique, génomique, épigénétique
manager icon Responsables :
Marcel Turcotte David Sankoff
host icon Hôte : Université d’Ottawa

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Titre du colloque :

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Thème du colloque :

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