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Caractérisation des événements de conversion génique dans le génome de la levure

Guy Drouin
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Guy Drouin

Résumé du colloque

Plusieurs exemples de conversion géniques entre les membres de familles multigéniques sont connus. Par contre, aucune étude n'avait, jusqu'à maintenant, présentée une analyse détaillée de tous les évènements de conversion génique dans le génome d'une espèce particulière. La banque de donnée de la séquence complète du génome de Saccharomyces cerevisiae (http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/) fut utilisée pour extraire les séquences des 52 familles multigéniques de la levure contenant trois séquences ou plus, dont les séquences avaient une valeur P-BLAST de 10^(-20) ou moins, et dont les séquences protéiques étaient alignées à plus de 80 %. Ces séquences furent analysées à l'aide d'un programme qui utilise la méthode de Sawyer (Mol. Biol. Evol. 6: 526-538) pour détecter les évènements de conversion génique. Cette Méthode de détection fut utilisée parce qu'elle est souvent plus efficace que d'autres méthodes (Drouin et al., 1999, Mol. Biol. Evol. 16: 1369-1390) et qu'elle permet d'identifier les gènes impliqués dans des évènements de conversion génique. Les méthodes de mesure statistique de Stephens (Mol. Biol. Evol. 2: 539-556) furent aussi utilisées pour déterminer la taille et la position des évènements de conversion génique. Les résultats de ces analyses, ainsi que les caractéristiques des évènements de conversion génique qui furent détectés dans le génome de la levure, seront présentés.

Contexte

Section :
Biologie informatique
news icon Thème du colloque :
Biologie informatique
manager icon Responsables :
Nadia El-Mabrouk
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

Biologie informatique
Caractérisation des événements de conversion génique dans le génome de la levure
Guy Drouin
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