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Caractérisation et identification des souches de Frankia en comparant un segment du 16S l'ADN

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Benoit Cournoyer

Résumé du colloque

Les souches du genre Frankia sont des actinomycètes capables de convertir l'azote gazeux en ammonium grâce au complexe de la nitrogénase. Au champ, nous les retrouvons en symbiose avec des plantes dicotylédones pionnières des genres Alnus, Casuarina, Hippophae, etc. Cette association a donné lieu à plusieurs applications comme la stabilisation des dunes et l'enrichissement de sols endommagés et pauvres en complexes azotés. Ce travail a consisté en l'identification de zones de variations au niveau d'un segment de plus de 280 pb du 16S l'ADN chez plus d'une trentaine de souches de Frankia en utilisant la réaction en chaîne de la polymérase (PCR). Ces variations nous permettront d'étudier la distribution et la compétition entre les souches par l'entremise de sondes moléculaires. La portion du gène analysée a permis en parallèle avec les regroupements obtenus par hybridation de l'ADN. La sensibilité de détection de la méthode PCR a également permis d'identifier les groupes génomiques à partir d'échantillons de nodules (excroissances racinaires où se déroulent les échanges de l'azote fixé). Cette nouvelle approche ouvre la voie à la caractérisation de souches non-isolables par les techniques conventionnelles.

Contexte

news icon Thème du colloque :
Sciences de l'environnement
host icon Hôte : Université Laval

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Titre du colloque :

Sciences de l'environnement

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