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Carte physique de la région contenant le locus de résistance cmv1 sur le chromosome 6 de la souris

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Chantal Depatie

Résumé du colloque

Plusieurs maladies infectieuses chez l'humain ont un système modèle d'infection chez la souris. Il devient donc possible d'étudier aisément les modalités d'infection sous plusieurs aspects. L'existence d'un modèle de souris résistant et sensible à l'infection par le cytomégalovirus nous permet d'entreprendre la méthodologie du clônage positionnel pour isoler le gène candidat. En effet, un locus génétique unique, cmv1, localisé sur le chromosome 6 de la souris, contrôle la résistance envers cette infection et se manifeste comme étant un allèle résistant (cmv1r) ou susceptible (cmv1s). La résistance se définit par une diminution de la réplication virale dans la rate, un effet attribué à l'activité des cellules NK (natural killer). Le clônage positionnel requière la génération d'une carte génétique détaillée de la région pour identifier des marqueurs étroitement liés à cmv1 afin de procéder à la génération de la carte physique de l'interval contenant notre gène d'intérèt. Suite à la génération de la carte génétique détaillée positionnant cmv1 dans un interval génétique de 0.7 cM, nous avons établis une carte physique partielle de cette région représentée par un contig de clônes génomiques de YACs et de BACs. Ces clônes ont servis à la génération et au positionnement de plusieurs nouveaux marqueurs représentant des extrémités de clônes génomiques, des gènes contenus dans l'interval ou des dinucléotides répétés qui ont permis de réduire l'interval génétique à 0.35cM En caractérisant cmv1 et la protéine qu'elle produit, il est possible de mieux comprendre le phénomène de résistance associé avec l'activité des cellules NK.

Contexte

manager icon Responsables :
Rémy Aubin
host icon Hôte : Université d’Ottawa

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