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Résumé du colloque
Certains Agrobacterium spp. ont la capacité d'induire des tumeurs végétales dans lesquelles de nouveaux dérivés d'acides aminés ou sucres, appelés opines, sont produits. Ces opines, qui favorisent la croissance et la conjugaison des Agrobacterium spp., pourraient ainsi agir dans une niche écologique que ces bactéries occupent. Plusieurs études ont remis en question cette hypothèse et, dans une perspective d'utilisation agronomique, il devient nécessaire d'analyser les opines. Cette étude avait pour objectif de déterminer l'importance de l'utilisation des opines chez des rhizobactéries. Dans un premier temps, 60 souches de la collection d'Allie Inc. ont été évaluées dans un milieu minéral liquide contenant l'octopine (oct), l'acide octopinique (aoc), la nopaline (nop), la mannopine (mop), ou la succinamopine (sap). Dans le même temps, près de 54% des souches illustratrices, des spp. fixatrices d'azote (N2) atmosphérique ont été évaluées pour leur capacité à utiliser l'oct ou l'aoc. Des rhizobactéries en collection, 12, 1 et 0.5% se sont avérées capables d'utiliser l'oct, l'aoc et la sap, respectivement. Aucune souche n'a pu cataboliser le nop et la mop. Des souches illustratrices d'oct, près de 54% étaient des Enterobacter spp. fixatrices d'N2. Des cycles d'enrichissement de 5 à 10^7 rhizobactéries se sont avérées capables d'utiliser l'oct, l'aoc ou l'aoc. Ces souches appartenaient à la famille des Rhizobiaceae, tel que genre Pseudomonas et Flavobacterium spp., et ne pas la capacité de fixer l'N2. Le catabolisme des opines par les rhizobactéries peut être considéré comme un phénomène rare pour la nop et la mop, occasionnel pour l'oct et la sap, et fréquent pour l'oct.
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