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Clonage d'un gène chez le riz, homologue au gène de souris responsable de la résistance à la tuberculose

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Abdelmajid Belouchi

Résumé du colloque

L'existence d'un modèle de souris résistantes et de souris sensibles au BCG, couplé à la méthode de clonage positionnel, ont permis d'identifier un gène candidat appelé Nramp (résistance naturelle associée à une protéine du macrophage). La fonction de cette protéine est encore inconnue, par contre, son profil d'hydropathie suggère qu'il s'agirait d'une protéine transmembranaire ayant 12 segments hydrophobes. L'homologie la plus frappante de cette protéine avec une protéine dont la fonction est le transport du nitrate chez A. nidulans se limite à un motif qui régirait le couplage de sous-unités liant l'ATP pour fournir l'énergie de transport. L'hypothèse que Nramp transporterait le nitrate au niveau du phagolysosome pour fournir du NO comme agent toxique pour les parasites a été retenue. Lors d'une recherche de routine effectuée sur ordinateur pour identifier des séquences montrant de l'homologie à la protéine d'intérêt, il est ressorti 3 séquences partielles de la banque d'expression de séquences anonymes (EST), dont deux proviennent du riz (O. sativa) et une de Arabidopsis thaliana. Il était alors évident de cloner ces homologues chez la plante, puisque ce système s'apprête bien à vérifier la fonction hypothétique retenue, soit le transport du nitrate. Nous présenterons le clonage et la caractérisation de 3 gènes chez le riz (Osnramp-1, Osnramp-2, Osnramp-3), ainsi que l'expression dans les tissus.

Contexte

host icon Hôte : Université McGill

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