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Comparaison des variations génomiques intra- et intersérotypiques chez le virus de la nécrose pancréatique infectieuse (VNPI)

Joël Heppell
Laurent Berthaume
Maximilien Arella
JH

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Joël Heppell

Résumé du colloque

Le virus de la nécrose pancréatique infectieuse (VNPI) est reconnu pour sa ubiquité et le taux parfois élevé de mortalité qu'il peut induire chez les jeunes alevins de certains salmonidés. Jusqu'à dix sérotypes (A1 à A10) ont été identifiés. Parmi ceux-ci, cinq seraient présents sur le continent nord-américain et un seul au Québec (A1). Toutefois, aucune étude n'a été effectuée jusqu'à ce jour sur la diversité des souches virales isolées au Québec. Afin d'étudier les variations génomiques entre 37 souches de VNPI, dont 18 du Québec, des fragments de 359 pb ont été amplifiés par PCR à partir de chacune d'elles. Les cDNA ainsi obtenus ont ensuite été digérés par cinq endonucléases de restriction. La comparaison des profils de digestion a permis de vérifier la hétérogénéité des souches. Des variations ont été observées entre les souches parfois aussi similaires à que celles retrouvées entre les différents sérotypes. Le séquençage de quelques uns des fragments amplifiés par PCR a confirmé ces variations. Suite à ces conclusions, il apparaît important d'effectuer des études sur la diversité génétique des poissons afin de limiter la dissémination des souches virales, d'autant plus qu'il a été démontré qu'elles n'ont pas toutes la même virulence.

Contexte

Section :
L'avenir de l'élevage des ombles au québec
news icon Thème du colloque :
L'avenir de l'élevage des ombles au québec
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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