Colloque

Détection et identification de ces agents de lutte biologique si semblables aux ravageurs

André Lévesque

Patrice Rey

Tharcisse Barasubiye

James Tambong

Gaétan Le Floch

Membre a labase

André Lévesque

Résumé du colloque

Les espèces fongiques des genres Pythium et Fusarium regroupent à la fois des agents de lutte biologique et des saprophytes, retrouvés couramment dans le sol et dans les systèmes de production hydroponique. En pratique, les champignons de ces deux genres sont très difficiles à identifier au niveau morphologique, si bien qu'il devient justifié de mettre au point des outils fiables et rapides pour différencier les souches de Pythium ou de Fusarium non agressives utilisées en lutte biologique des agents plus virulents du même groupe. Dans les serres, le Pythium nunn et le P. oligandrum ont été utilisés avec succès pour lutter contre les espèces de P. dissotocum ou de P. aphanidermatum, mais les méthodes traditionnelles d'isolement ne permettent pas une discrimination rapide de l'agent de lutte et de l'agent pathogène. Grâce aux données génomiques et à la bioinformatique, il est maintenant possible de cribler les espèces connues des deux genres pas des essais rapides. Un suivi de la colonisation racinaire par P. oligandrum et P. dissotocum dans une serre expérimentale de tomate pendant une saison culturale a été réalisé par PCR et hybridation sur biopuces d'ADN. L'agent antagoniste a pu être détecté immédiatement après son inoculation, jusqu'en fin de culture; P. dissotocum, une espèce prédominante dans ce type de culture, était aussi détectée tout au long de l'expérimentation (6 mois). La comparaison des résultats obtenus par PCR et hybridation avec ceux obtenus par une technique classique sur milieux sélectifs a permis de révéler l'apport positif des outils moléculaires, notamment une meilleure identification des différentes espèces colonisant la rhizosphère en culture hors-sol, et un seuil de détection nettement abaissé.

Contexte

Section :

Protection des cultures dans un contexte de réduction de l'utilisation des pesticides chimiques

Thème du colloque :

Protection des cultures dans un contexte de réduction de l'utilisation des pesticides chimiques

Hôte : Université du Québec à Montréal

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