Colloque

Détermination de la séquence complète de 20 gènes rbcL chez les arbres: implications évolutives chez les plantes

Jean Bousquet

Steven Strauss

Membre a labase

Jean Bousquet

Résumé du colloque

Le gène chloroplastique codant pour la grosse sous-unité de l'enzyme ribulose 1,5-diphosphate carboxylase (rbcL) a déjà été séquencé chez un certain nombre d'espèces monocotylédones et herbacées dicotylédones. Ces séquences ont permis de déterminer des relations phylogénétiques ainsi que d'estimer les taux de substitution et certaines dates de divergence. Nous avons déterminé la séquence complète de ce gène 1437 pb pour une vingtaine d'espèces d'arbres membres des familles Podocarpaceae, Taxodiaceae, Pinaceae, Magnoliaceae, Betulaceae, Fagaceae, Hamamelidaceae, Salicaceae. L'ADN fut amplifié par réaction de polymérisation en chaîne et directement séquencé en condition dénaturantes. Les séquences de plante déjà publiées furent ajoutées et alignées par les analyses numériques. Les taux de substitution synonymique ou non synonymique furent calculés. Des méthodes de parcimonie et d'analyse de distance ont été utilisées afin d'assumer pas d'homogénéité de taux de substitution ont été utilisées afin d'obtenir les arbres phylogénétiques. Les méthodes de maximum de vraisemblance ont été utilisées pour mesurer la signification statistique des topologies obtenues. Chez les Pinaceae et les Taxodiaceae, les arbres phylogénétiques obtenus sous les trois méthodes sont en accord avec les hypothèses actuelles basées sur des données morphologiques et isoenzymatiques. Les analyses de distance révèlent des confiances assez faibles pour les relations des sous familles. Les analyses de parcimonie et de distance démontrent que les arbres obtenus pour les familles des Pinaceae et des Taxodiaceae et les familles des Alismataceae sont homologues aux mêmes taux. Les plantes des familles des monocotylédones aux dicotylédones, ces derniers sont significativement beaucoup plus rapides. Les formes pérennes semblent se développer beaucoup plus lentement que les formes herbacées dont l'évolution est subventionnée par CRSNG).

Contexte

Section :

Botanique et écologie végétale

Thème du colloque :

Botanique et écologie végétale

Hôte : Université de Sherbrooke

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Titre du colloque :

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