Colloque

DNA methylation and gene expression differences in children conceived in vitro or in vivo

Carmen Sapienza

Marina Bibikova

Oluwatoyin Erinle

Raffi Chalian

Mike Foster

John Gaughan

Christos Coutifaris

Sunita Katari

Nahid Turan

Membre a labase

Carmen Sapienza

Résumé du colloque

Les données épidémiologiques suggèrent que les enfants conçus in vitro présentent un risque relatif plus élevé de maladies rares faisant intervenir des gènes marqués. Les études expérimentales sur les animaux indiquent également que les modifications épigénétiques sont associées aux procédures utilisées dans la procréation médicalement assistée. Nous avons examiné les niveaux de méthylation de l’ADN à 1 536 sites CpG du placenta et d’échantillons de sang de cordon ombilical d’enfants conçus in vitro et in vivo. La comparaison des écarts de la méthylation suggère que l’effet global de la conception in vitro est une perte de méthylation aux sites CpG du placenta, et un gain de méthylation aux sites CpG du sang de cordon ombilical. La stratification des écarts de la méthylation moyenne spécifique aux sites CpG entre les deux groupes a résulté en un ensemble de 78 gènes dont les niveaux moyens de méthylation différaient dans le sang de cordon ombilical, et de 40 gènes dont les niveaux moyens de méthylation différaient dans le placenta. Nous avons comparé les niveaux d’état d’équilibre de l’acide ribonucléique messager (ARNm) de 12 de ces gènes, et nous avons découvert des écarts considérables dans le niveau moyen d’expression entre ces deux groupes chez cinq gènes. Nos résultats indiquent que la conception in vitro est associée à des modifications fonctionnelles de l’expression génétique chez certains loci, à leurs lignées embryonnaires (sang de cordon ombilical) ou extra embryonnaires (placenta). La portée et la distribution de la variation interindividuelle de l’expression génétique des groupes in vitro et in vivo se chevauchent considérablement, mais certains individus du groupe in vitro sont à plus de deux déviations standards par rapport à la moyenne in vivo.

Contexte

Section :

Bioinformatique, génomique, épigénétique

Thème du colloque :

Bioinformatique, génomique, épigénétique

Responsables :

Marcel Turcotte David Sankoff

Hôte : Université d’Ottawa

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Titre du colloque :

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