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Dynamique de relaxation des protéines en états de charge variable

Gustavo Arteca
GA

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Gustavo Arteca : Université Laurentienne

Résumé du colloque

En utilisant des mesures de mobilité et section efficace pour la migration d'ions, il est maintenant possible d'étudier des propriétés conformationnelles des protéines déshydratées dans le vide. L'expérience nous montre l'existence d'une charge critique pour le dépliement d'une structure native. Dans cette présentation, nous proposons une interprétation théorique pour ces résultats expérimentaux en utilisant des simulations de dynamique moléculaire. Comme exemple, nous considérons le comportement des ions de lysozyme. Pour l'analyse des trajectoires, nous utilisons deux paramètres d'ordre associés à l'anisométrie et les enchevêtrements de la chaîne. Ceci nous permet de comprendre l'évolution séparée de la compacité de la chaîne et sa topologie. Nos résultats montrent un patron bien défini pour le rôle de la charge de l'ion et la température dans la transition de dépliement d'une protéine. Nous discutons les différences entre le comportement des protéines et celui des polyélectrolytes sans structure secondaire. D'ailleurs, nous présentons nos observations dans le contexte des théories récentes pour la transition de repliement vers la structure native d'une protéine.

Contexte

Section :
La chimie théorique de l'an 2000 : perspectives de développement et d'applications
news icon Thème du colloque :
La chimie théorique de l'an 2000 : perspectives de développement et d'applications
manager icon Responsables :
Tucker Carrington Mark E. Casida
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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