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Effet de position sur un gène rapporteur de recombinaison génétique chez la plante Arabidopsis thaliana

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Samuel Santerre-Ayotte

Résumé du colloque

La recombinaison génétique est un phénomène important pour la diversité génétique et le brassage des gènes. Dans le cadre de travaux utilisant un rapporteur de recombinaison inséré aléatoirement dans le génome d'Arabidopsis thaliana, des lignées à haut et à faible taux de recombinaison ont été observées. La position aléatoire du rapporteur chez ces lignées laisse croire à l'existence d'un effet de position causé par des paramètres génétiques liés au site d'insertion. Notre projet vise à vérifier si la composition de l'environnement génétique du rapporteur de recombinaison pourrait expliquer l'effet de position observé. Le premier volet du projet porte sur la sélection de lignées montrant des taux de recombinaison élevé ou faible. Le deuxième volet du projet porte sur la comparaison de l'environnement génétique des lignées à haut et à faible taux de recombinaison. Le repérage de la position du rapporteur dans le génome et la documentation des paramètres comme le contenu en G+C, le taux de transcription et le degré de méthylation sont utilisés pour comparer l'environnement du rapporteur chez les lignées à haut et à faible taux de recombinaison. Les analyses sont en cours et devraient permettre de mieux comprendre les paramètres importants impliqués lors de la recombinaison génétique.

Contexte

host icon Hôte : Université du Québec à Montréal

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