Communication

Effet du surenroulement de l'ADN sur la transcription chez E. coli : régulation de l'élongation du gène lacZ via les R-loops

Josiane Demers

Marc Drolet

Membre a labase

Josiane Demers

Résumé de la communication

Notre laboratoire a démontré qu'un des rôles majeurs des topoisomérases lors de la transcription chez E. coli est de réguler la formation de R-loops; un hybride ADN-ARN qui peut se former entre l'ARN naisant et le brin matrice de l'ADN. La RNase H est aussi impliquée dans le contrôle des R-loops; elle permet leur élimination en dégradant la portion ARN de l'hybride. Nous avons déjà mis en évidence la formation de R-loops dans un fragment de la région ARNr 16S de l'opéron rrnB de E. coli ainsi que dans le gène tet codant pour la résistance à la tétracycline. Ces structures peuvent interférer avec plusieurs fonctions de l'ADN (recombinaison, transcription, réplication). En effet, nous avons démontré récemment que les R-loops formés durant la transcription des opérons rrn causaient un blocage de l'élongation. Ces travaux mettent en évidence la formation de R-loops dans un autre gène soit le gène lacZ codant pour la b-galactosidase. Des constructions contenant le gène lacZ sous contrôle d'un promoteur inductible furent introduites sur le chromosome de souches isogéniques mutées dans les gènes codant pour la topoI et/ou la gyrase. Les résultats de dosage de l'activité b-gal et de l'analyse de l'ARN par Northern, montre un effet RNase H sur l'expression de lacZ chez le mutant topA. Ceci indique que, suite à la formation de R-loops dans ce gène, il y a blocage de l'élongation de la transcription. Les premiers 200 nucléotides de lacZ est la région où se formeraient les R-loops. Ces résultats laissent croire que la formation de R-loops dans certaines régions transcrites serait plus fréquente que supposé et que le contrôle de ces hybrides pourrait s'avérer un mécanisme générale de l'expression génique.

Contexte

Section :

Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire

Domaine de la communication :

Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire

Hôte : Université de Montréal

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