Colloque

Estimation des corrélations phylogénétiques entre données moléculaires et traits de vie

Raphael Poujol

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Raphael Poujol

Résumé du colloque

De nombreux gènes ont un rôle dans la dégénérescence des cellules, le stress oxydatif et le vieillissement prématuré. En supposant que ces gènes sont soumis à une plus forte pression sélective chez les espèces longévives il est alors possible de mesurer leur implication dans le vieillissement par le biais d'une analyse phylogénétique. L'objet principal de cette étude est le développement d'une méthode statistique Bayésienne permettant la reconstruction de l'histoire de la longévité, de la pression sélective (w = dN / dS), le ratio du taux de substitution non-synonyme (dN) et du taux de substitution synonyme (dS) et de leur corrélation le long des branches d'un arbre phylogénétique. La matrice de covariance, le processus brownien bivarié et tous les paramètres du modèle sont estimés grâce a un algorithme MCMC (Markov Chain Monte Carlo). Le modèle sera appliqué a l'ensemble des gènes orthologues connus chez les mammifères, la probabilité a posteriori d'une corrélation négative entre la longévité et l'histoire de la pression sélective indiquera une implication de ce gène dans la régulation du vieillissement.