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Résumé du colloque
Les méthodes de calcul conformationnel et de modélisation moléculaire ont été appliquées à l'étude des peptides Pro-D-Ala et Pro-D-Ala-Ala. On a utilisé un programme développé au laboratoire, PEPSCAN, qui permet de générer aléatoirement et de minimiser des populations de conformères. L'analyse des populations par méthodes statistiques et de dynamique moléculaire permet d'explorer l'espace conformationnel des molécules. Les peptides contenant un résidu proline sont connus pour adopter des structures en tournants. On a également que les peptides linéaires de ce type, contenant deux tournants β successifs sont susceptibles de complexer sélectivement le calcium. On présentera les résultats conformationnels obtenus par analyse des populations conformationnelles de chaque peptide. On proposera également des conformations possibles pour les complexes peptides/calcium ainsi que des pré-requis conformationnels à la formation de ces complexes.
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