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Étude de l'interaction entre la protéine ribosomique S7 et le RNA 16S

François Dragon
Lea Brakier-Gingras
FD

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François Dragon

Résumé du colloque

La caractérisation du site de liaison d'une protéine sur le RNA ribosomique peut préciser quels sont les signaux qui contrôlent la spécificité de cette interaction RNA - protéine. Nous avons examiné l'interaction de la protéine S7 avec le RNA 16S du ribosome d'E. coli. On sait que cette protéine interagit avec le domaine 3 du RNA 16S. Différents plasmides ont été construits, à partir desquels nous pouvons obtenir par transcription in vitro soit le domaine 3 complet (positions 926 à 1393), soit divers fragments de ce domaine. Nous avons ensuite examiné, par la technique de filtration sur membranes de nitrocellulose, comment la protéine S7 interagit avec les RNAs transcrits. Nos résultats indiquent qu'un fragment d'environ 120 nucléotides (positions 926-946 / 1235-1239 / 1298-1393), à la base de ce domaine 3 conserve la capacité de lier la protéine S7. L'introduction de mutations dans ce fragment souligne l'importance des structures irrégulières (notamment des paires non-canoniques) pour l'interaction entre S7 et le RNA.

Contexte

Section :
Biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biologie moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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Thème du colloque :

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