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Résumé du colloque
Il a été démontré par des études en dichroïsme circulaire, RMN et HPLC que la gramicidine peut adopter différentes conformations dans des bicouches lipidiques. Plusieurs facteurs peuvent influencer la conformation que la gramicidine adoptera à l'intérieur de dispersion de lipides, comme le rapport peptide/lipide, le solvant dans lequel le peptide et le lipide sont initialement dissous, le temps et la température d'incubation. Nous avons étudié les interactions entre la gramicidine et une membrane modèle composée d'un phospholipide, phosphatidylcholine/myristoyl (DMPC), en fonction du solvant de dispersion et du temps d'incubation. Trois solvants furent utilisés, soit le tri-fluoroéthanol (TFE), un mélange méthanol/chloroforme (1:1 v/v) et l'éthanol. En utilisant la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (FTIR), il est possible de démontrer que la conformation adoptée par la gramicidine dans la membrane est dépendante du solvant de dispersion et seulement avec le TFE il est possible d'incorporer entièrement la gramicidine sous la forme d'une hélice β3. L'effet de l'incorporation de la gramicidine sur la thermotropie de la bicouche lipidique ainsi que l'orientation du peptide dans la membrane sont également dépendants du solvant de dispersion et du temps d'incubation. D'autre part, la spectroscopie Raman fut utilisée dans le but d'étudier l'environnement des résidus tryptophane de la gramicidine et leur interaction avec les chaînes hydrocarbures du lipide.
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