Communication

Étude du frameshift ribosomique du groupe O du virus de l'immunodéficience humaine dans un système bactérien

Sacha Sidani

Lea Brakier-Gingras

Membre a labase

Sacha Sidani

Résumé de la communication

La synthèse de la protéine Gag-Pol, le précurseur des activités enzymatiques du VIH-1, requiert un changement du cadre de lecture (frameshift) programmé –1 lors de la traduction de l'ARN messager viral. Les ribosomes effectuent ce frameshift au niveau d’une séquence glissante spécifique, suivie d’une structure particulière, le signal stimulateur, qui interagirait avec les ribosomes pour stimuler le frameshift. Chez le groupe M du VIH-1, le groupe le plus répandu dans le monde, ce signal est une longue hélice irrégulière, alors que chez le groupe O, rencontré surtout en Afrique, ce signal est un pseudonoeud. Notre but est d’étudier si le ribosome bactérien reconnaît le signal stimulateur du frameshift du groupe O. L’avantage du ribosome bactérien est que sa structure est connue à une résolution atomique et il se prête aisément à des manipulations génétiques. Nous avons cloné dans un vecteur d’expression approprié la région du frameshift du groupe O du VIH-1, amplifiée par PCR à partir d’un vecteur eucaryote. Cette région a été insérée au début de la région codante d’un gène rapporteur, codant pour la luciférase. La construction est telle que seuls les ribosomes faisant un frameshift produisent la luciférase et la mesure de l’activité luciférase permet d’évaluer l’efficacité de frameshift. Nous avons soumis la région du frameshift à diverses mutations éliminant et reformant le pseudonoeud et observé que l’efficacité de frameshift est maximale en présence du pseudonoeud, montrant que le ribosome bactérien répond à ce signal comme le ribosome eucaryote et constitue un système approprié pour l’étude du mécanisme d’action de ce signal.

Contexte

Section :

Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire

Domaine de la communication :

Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire

Hôte : Université du Québec à Montréal

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