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Étude phylogénétique de Phaeotheca dimorphospora

Zahra Moungid
Luc Giasson
Luc Simon
Jean Bousquet
ZM

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Zahra Moungid

Résumé du colloque

Phaeotheca dimorphospora est un deutéromycète récemment isolé. Des travaux préliminaires ont démontré des différences importantes entre les séquences d'ADN ribosomique 18S de P. dimorphospora et de P. fissurella, l'espèce type du genre Phaeotheca. De plus, ces travaux ont révélé une grande similitude entre les séquences d'ADN ribosomique 18S de P. dimorphospora et celles d'autres loculoascomycètes dont les genres Cucurbitaria et Pleospora. Afin de déterminer plus précisément la position phylogénétique de P. dimorphospora, une analyse des séquences de l'ADN ribosomique 18S a été réalisée pour sept espèces de Pleospora et Cucurbitaria. L'ADN ribosomique 18S a été amplifié par PCR et séquencé. Une séquence partielle d'environ 1730pb du gène ribosomique 18S a été obtenue pour chaque souche. Des séquences du gène 18S de 37 espèces de loculoascomycètes ont également été sélectionnées pour des fins comparatives à partir de la banque de données GenBank. Les séquences ont été alignées et soumises à différentes analyses phylogénétiques dont la méthode de parcimonie et la méthode de «neighbor-joining», effectuée à partir d'une matrice de taux de substitution découlant de la comparaison des séquences. Les résultats indiquent un regroupement cohérent des Pleosporaceae d'une part, et d'autre part d'un groupe formé de souches de Dothideaceae et Botriosphaeraceae. P. dimorphospora s'est retrouvée étroitement associée à des souches du genre Cucurbitaria au sein des Pleosporaceae, alors que P. fissurella fut placée dans le second groupe formé de représentants des Dothideaceae et Botriosphaeraceae. Ces résultats indiquent donc l'appartenance de ces deux souches à des familles différentes, suggérant une révision de leur classification au sein du même genre.

Contexte

Section :
Microbiologie, virologie
news icon Thème du colloque :
Microbiologie, virologie
host icon Hôte : Université Laval

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Titre du colloque :

Microbiologie, virologie
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