Colloque

Études RMN de la conformation du ribose du poly(I) en tétramère

Stéphane Levasseur

Michèle Auger

Rodrigue Savoie

Membre a labase

Stéphane Levasseur

Résumé du colloque

Certains polyribonucléotides, comme les acides polyguanylique et polyinosinique poly(I), peuvent s'auto-associer en solution saline pour donner une hélice quadruple. Ce type de structure contient un canal central dans lequel s'insèrent des ions qui stabilisent l'ensemble. Même si la conformation des riboses dans les acides ribonucléiques est presque exclusivement C3'-endo, des études récentes par spectroscopie Raman ont suggéré que cette conformation pourrait être C2'-endo dans la forme associée du poly(I). La présente étude par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire en solution et à l’état solide a été entreprise afin de vérifier cette hypothèse. A partir de cette méthode, il est possible de déterminer une conformation en mesurant des distances internucléaires à l'aide de l'effet NOE ("nuclear Overhauser effect"). Celui-ci entraîne un changement de l'intensité du signal d'un proton lorsque l'un des protons voisins est irradié. Le taux de croissance de la variation du signal nous informe sur la distance séparant les noyaux impliqués. Nous avons appliqué avec succès cette technique à la guanosine-5'-monophosphate en solution. Par contre, nous avons trouvé que l'auto-association du poly(I) réduit la mobilité moléculaire, ce qui cause un élargissement des pics de résonance et rend difficile la mesure de distances par effet NOE. On espère pouvoir atténuer ce élargissement dipolaire par rotation à l'angle magique en spectroscopie RMN des solides.

Contexte

Section :

Biotechnologie, biophysique

Thème du colloque :

Biotechnologie, biophysique

Hôte : Université McGill

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