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Résumé du colloque
L'organisation des gènes chez les eucaryotes est marquée par l'interruption fréquente d'introns. En concomitance avec la transcription, les introns sont épissés, et ne participent pas dans l'ARN maturé qui se transfère vers le cytoplasme pour traduction. D'anciennes questions reliées à l'origine, l'évolution et la fonction des introns peuvent maintenant être addressées du fait que l'on ait à notre disposition des génomes complets. Je parlerai de quelques avancées récentes, incluant des défis algorithmiques et des découvertes biologiques. Notamment, l'analyse comparative à grande échelle indique que les génomes ancestraux des eucaryotes contenait beaucoup d'introns (comparable à la densité d'introns chez l'humain) qui sont arrivés dans le lignée protoeucaryotique, et que la plupart de lignées eucaryotiques sont caracterisés par une perte d'introns de taux variable. Références: [1] M Csuros. "Likely scenarios of intron evolution." Proc. RECOMB CG, Springer LNCS 3678:47-60, 2005. [2] AV Sverdlov, M Csuros, IB Rogozin, EV Koonin. "A glimpse of a putative pre-intron phase of eukaryotic evolution." Trends in Genetics, 23:105-108, 2007. [3] M Csuros, JA Holey, IB Rogozin. "In search of lost introns." Bioinformatics 23:i87-i96, 2007. [4] M Csuros, IB Rogozin, EV Koonon. "Extremely intron-rich genes in the alveolate ancestors inferred with a flexible maximum likelihood approach." Molecular Biology and Evolution, 25:903-911, 2008.
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